自2016年4月北京大学批准筹建研究院以来，北京大学城市治理研究院多次主持或参与国家级课题研究、主持政府部门或重点企业等委托课题若干项。
部分科研课题包括：
常州市城市运行“一网统管”城市治理研究，常州市城市管理局，2022年；
海淀街道城市更新发展战略，北京市海淀街道办事处，2022年；
统筹推进“疏整促”专项行动与北京城市更新的创新模式研究，首都智库项目，2022年；
关于具有首都特点的城市更新探索研究，首都智库项目，2021年；
南京数字治理模式研究，南京市大数据局，2021年；
增加中心城市经济和人口承载能力问题研究，国家发改委，2020年；
辽宁省国民经济和社会发展第十四个五年规划，辽宁省发改委，2020年；
重庆大城三管创新模式研究，重庆市城市管理局 ，2020年；
首都国土空间规划执行体系与运行绩效评估，北京市规自委，2020年；
城市复兴视角下的街区更新理论实践研究、北京市街区文化发展调研报告，北京市市委研究室，2018年；
城市综合管理服务平台建设课题研究、大数据辅助城市治理决策分析应用研究，住建部城管监督局，2018年；
城市综合管理服务平台建设课题研究，住房城乡建设部城市管理监督局， 2018年；
城市管理大数据建设实例化应用场景研究，北京市城市管理执法局，2018年；
城市治理模式创新、城市治理现代化指数和“12345+网格化的社会治理模式研究，海口市人民政府办公厅，2018年；
构建以公众满意度为导向的首都城管执法模式实证研究，北京市城市管理执法局，2017年；
智慧社区研究，北京智慧社区产业技术创新联盟，2017年；
中山社会治理预警机制研究，中山市政法委，2017年；
城市治理现代化模式研究——以青岛市北区为例，青岛市北区， 2017年；
城市治理现代化评估指标体系研究，青岛市北区，2017年；
城市地下空间综合治理调研，浙江金洲管道科技股份有限公司，2016年；
全民共建共享的社会治理格局研究，中山市社会工作委员会，2016年。